Pembelajaran di SMAIT Abu Bakar Boarding School Kulon Progo didukung oleh keberadaan perpustakaan sekolah. Perpustakaan sekolah memiliki beragam koleksi buku yang memperkaya wawasan kelimuan siswa. Di dalamnya tersedia buku-buku mata pelajaran, buku-buku keislaman, dan buku-buku lain dalam bidang ilmu-ilmu alam dan ilmu-ilmu sosial yang senantiasa diperbaharui mengikuti perkembangan ilmu, pengetahuan, dan teknologi.